您的当前位置:首页正文

TagDNA酶纯化方法

2022-08-31 来源:榕意旅游网


快速纯化DNA聚合酶

细菌培养:

选取单个菌落在LB(含有Amp 80ug/mL)培养基中过夜培养。

接种500uL 过夜培养物到750 mL LB(含有Amp 80ug/mL)培养基中在2000mL 培养瓶中。总共培养3×750mL。

37℃ 培养12小时到OD600=0.8 摇床速度为不低于200rpm。

加入IPTG(储存浓度为100mM)至终浓度为0.5mM,大约需要10 mL IPTG

继续培养10小时,不要超过12小时。

收获细菌:

在GS3转子在5000rpm 离心20分钟,弃上清。

用buffer A 每管加入100mL 洗涤细菌沉淀。

buffer A配方:50mM Tris-HCL,pH7.9

50mM dextrose(葡萄糖)

1mM EDTA

3.5000rpm 离心细菌

裂解细菌:

制作新鲜前裂解buffer(BufferA + 4mg/mL 融菌酶)

在每个离心管中加入50mL 前裂解buffer 重悬细菌,细菌应该完全重悬,不应该有团块。

室温下孵育15分钟。

加入相等体积的裂解buffer(lysis buffer),其配方为:

20mM Tris-HCL,pH7.9;50

50mM KCL

1mM EDTA

1mM PMSF

0.5% Tween 20

0.5% NP40

如果配置100mL( Tris-HCL 2mL;KCL 5mL; 0.2mL EDTA; PMSF 0.2mL

10% Tween 20 5mL;10% NP40 5 mL)

很好的混匀,溶菌液将是黏性的。

将所有的溶菌液转移到1-2个塑料瓶中

孵育全部200mL 裂解液在75℃水浴1 小时。

分离Tag酶;澄清裂解混合物:

1.4℃ 15000rpm 离心10 分钟

2.将上清加到SW28 转子 超速离心管中(35mL/管)

3.4℃ 26000rpm 离心45分钟(注意超离这步可以不作如果能看到1离下来沉淀)

硫酸铵沉淀:

转移澄清的裂解产物大约200mL 到一个干净的瓶子。

每一百毫升裂解产物慢慢加入30g硫酸铵粉末,在室温下快速搅动。硫酸铵的用量大约为50-60g,依赖于裂解产物的体积。

加入一半的硫酸铵后透明的裂解产物变成牛奶状,4℃ 15000rpm 离心10 分钟

收获蛋白沉淀

重悬蛋白沉淀,每100mL 最初的裂解产物用20 mL buffer B 重悬。

Buffer B 配方:

50mM Tris-HCL,pH7.9;

50mM KCL

0.1mM EDTA

1mM DTT

0.1mM PMSF

两步透析:

在buffer C中透析12 小时。50mM Tris-HCL,pH7.9;

50mM KCL

0.1mM EDTA

1mM DTT

配方:

Buffer C

0.5mM PMSF

2.第一次透析后,一定会有沉淀,这时4℃ 15000rpm 离心30 分钟,来澄清第一次透析产物。

3.重新将上清装入透析袋,在储藏透析缓冲液中过夜。这时你能浓缩Tag酶3倍。

储藏透析缓冲液配方:buffer C+50%甘油

用商品Tag酶来测定你制作的Tag酶活性:

注意:

大肠杆菌菌株:INF alpha F

过渡培养的细菌导致Tag酶降解。

纯化蛋白的过程:

诱导提蛋白:600ml重组菌+600μl IPTG诱导2.5h,6000rpm离心10分钟后冻存。

1.细胞以每克湿重2-5ml裂解缓冲液重悬。

2.加入溶菌酶(50mg/ml)至终浓度1mg/ml,冰浴30min。

3.冰上超声。10秒+10 6个循环,300W,用小超声头。

4.若裂解液粘稠,加入RNase A (10μg/ml)和DNase I (5μg/ml)冰浴10~15min。

5.1000g离心20~30min (4℃),取上清。(上清留样电泳)

6.将1ml 50%,Ni-NTA匀浆于4ml澄清裂解液中,于200rpm旋转摇床轻摇混匀,4℃, 60min。

7.将裂解液-Ni-NTA混和物上柱。

8.取流出液电泳分析。

9.以4ml wash buffer洗两次,留样电泳分析。

10.以0.5ml elution buffer洗脱蛋白4次,于四个tube收集,电泳分析。

(1) lysis buffer:(buffer A) (1L) pH=8.0 用NaOH调

50mM NaH2PO4 7.8g NaH2PO4.2H2O (156.01) 6.9g NaH2PO4.H2O (137.99)

300mM NaCl 17.54g NaCl (58.44)

10mM imidazole 0.68g imidazold (68.08) (实配1mM)

(2) wash buffer: (buffer B) (1L) pH=8.0

50mM NaH2PO4 7.8g NaH2PO4.2H2O

300mM NaCl 17.54g NaCl

20mM imidazole 1.36g imidazole (实配1mM)

(3) elution buffer: (buffer C) (1L) pH=8.0

50mM NaH2PO4

300mM NaCl

250mM imidazole 17.00g

(4) buffer A B C成份可根据特殊情况稍作修改,imidazole含量可根据蛋白与柱结合情况调整,(A中)结合弱可1-5mM,结合强可20mM。可加入0.1% Tween,5~10mM β-ME,1mM PMSF或增加NaCl,甘油离心。

(5) 使用完以10倍体积0.2M乙酸,30%甘油和水依次清洗,保存于30%乙醇中防微生物生长。

Ni-NTA活化:推荐5次/柱,若由浅兰变棕灰,则再生如下:建议流速0.5ml/min。

1.以2倍体积的再生缓冲液清洗 (6M GuCl,0.2M acetic acid)

2.以5倍体积的H2O冲洗。

3.3倍体积的2% SDS冲洗。

4.1倍体积25%乙醇洗。

5.1倍体积50%乙醇洗。

6.1倍体积.75%乙醇洗。

7.5倍体积100%乙醇洗。

8.1倍体积.75%乙醇洗。

9.1倍体积50%乙醇洗。

10.1倍体积25%乙醇洗。

11.1倍体积水清洗。

12.5倍体积100mM EDTA (pH 8.0)洗。

13.水洗。

14.2倍体积100mM NiSO4洗。

15.2倍体积水洗。

16.2倍体积再生缓冲液洗。

17.2倍体积buffer A或B平衡。

18.30%乙醇与beads等体积保存于4℃。

因篇幅问题不能全部显示,请点此查看更多更全内容