证明夫妻分居两年的证据包括：
1、一方在外居住的房屋租赁合同；
2、双方签订的夫妻分居书面协议，注意必须书面，口头协议必须由对方承认；
3、一方向另一方发出的书面分居文件，最好邮寄快件，在备注栏注明分居，并保留邮寄凭证。从邮寄之日起至提起离婚期间，属于夫妻分居时间；
4、双方之间的信件、电子邮件等。可以证明双方感情不和分居；
5、证人证言也可以，比如双方都认识的朋友或亲戚，但是因为证人往往和作证的一方有利害关系，分居是夫妻的私事，所以单独的证人证言很难被法院接受，所以需要辅以其他证据。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第一千零七十八条 婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。
第一千零七十九条 夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
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