员工工作不称职，处理方式如下：如果没有给单位造成损失，通常只是警告；如果给单位造成了损失，可以通过扣除工资来进行赔偿，但每月扣除的金额不得超过劳动者当月工资的20%；如果是严重的失职，给用人单位造成了重大损害，单位有权单方面解除劳动合同，并要求赔偿损失；还有其他情况。
法律分析
员工因工作失职，分以下情形处理：未造成单位损失的，一般除警告；造成单位损失的，通过扣除工资补偿损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%；严重失职，给用人单位造成重大损害的，单位单方面解除劳动合同，要求赔偿损失；其他。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条【用人单位单方解除劳动合同（过失性辞退）】劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反用人单位的规章制度的；（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；（六）被依法追究刑事责任的。《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条【劳动合同的无效】下列劳动合同无效或者部分无效：（一）以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；（二）用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的；（三）违反法律、行政法规强制性规定的。对劳动合同的无效或者部分无效有争议的，由劳动争议仲裁机构或者人民法院确认。 该内容由 路晓琳律师 和 家和律云 共创回答
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