经营许可证是法律规定的某些行业必须经过许可，而由主管部门办理的许可经营的证明，如烟草专卖许可证、药品经营许可证、危险化学品经营许可证等。
不同种类的经营许可证的申请流程不同，如下以食品经营许可证为例子介绍。
食品经营许可证的申请流程如下：
1、首先填写好食品经营许可证的申请表。
2、准备法人身份证复印件、从业人员身份证复印件和健康证。然后制定食品安全管理制度。
3、绘制店铺的平面图。提交缴纳税费单据证明，证实你所使用的水是正规自来水公司提供的。
4、到当地市场监督管理局提交如下资料
（1）《食品流通许可申请书》；
（2）《名称预先核准通知书》复印件；
（3）与食品经营相适应的经营场所的使用证明；
（4）负责人及食品安全管理人员的身份证明；
（5）与食品经营相适应的经营设备、工具清单；
（6）与食品经营相适应的经营设施空间布局和操作流程的文件；
（7）食品安全管理制度文本；
（8）省、自治区、直辖市工商行政管理局规定的其他材料。
5、资料提交成功之后，市场监督管理局会安排人员来看场地。
6、检查通过后，在一定时间内通知申请人来领取食品经营许可证。
法律依据：
《药品经营许可证管理形式》第三条 国家食品药品监督管理总局主管全国药品经营许可的监督管理工作。
省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门负责本辖区内药品批发企业《药品经营许可证》发证、换证、变更和日常监督管理工作，并指导和监督下级食品药品监督管理部门开展《药品经营许可证》的监督管理工作。
设区的市级食品药品监督管理部门或省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门直接设置的县级食品药品监督管理部门负责本辖区内药品零售企业《药品经营许可证》发证、换证、变更和日常监督管理等工作。
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