SCI发文神器MIMIC数据库如何免申请使用
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发布时间：2024-09-28 10:52
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时间：2024-09-28 10:45
MIMIC数据库作为开放获取的医疗资源，专注于重症监护领域，提供了丰富的临床数据。它涵盖波士顿医疗机构的数万名ICU患者信息，包括临床笔记、实验室结果、医疗影像和药物治疗等。该数据库对医学研究、数据分析和临床决策支持等领域具有重大意义，有助于提升重症护理质量与推动医学科研。
使用MIMIC数据库需遵循特定步骤。首先，申请者需通过CITI考试并获取证书。随后，通过MIMIC官方网站申请数据库使用权限。最新版本为MIMIC-IV。申请后，官方通常会通过邮件通知结果，但有被驳回的风险。若申请成功，用户需下载数据包，最新MIMICIV数据集为2.2版本，文件体积接近7GB。下载后，安装数据库推荐使用postgres，并参考安装教程。完成安装后，需将下载的数据导入数据库，整个过程涉及60GB数据，导入可能耗时3天，且需具备数据库知识。
鉴于使用流程的复杂性，我利用闲置服务器安装了MIMICIV-2.2版本数据库，并进行了优化，以提高数据提取效率。现提供服务器资源，用于便捷访问数据库。安装的数据库包含官方完整的物化视图，优化后显著提升了数据使用效率。MIMICIV_derived模块集成了官方完整的物化视图，包括患者真实年龄、首次实验室指标等关键信息。MIMICIV_hosp模块收录患者住院信息，涵盖非ICU患者的各种诊断、治疗、给药、手术等。MIMICIV_icu模块详细记录了患者入ICU的信息，为研究和临床决策提供了宝贵资源。
